Para clonar a unidade em outra unidade do mesmo tipo e com o mesmo tamanho ou maior, você pode usar o Clonezilla (e clonar a unidade inteira). Isso não deve afetar outras unidades.
Veja este link para mais detalhes sobre o Clonezilla,
O Clonezilla funciona se você ainda puder ler todos os setores (pelo menos todos os setores usados) da unidade.
Se houver setores defeituosos, é melhor usar ddrescue para clonar a unidade. Pode salvar informações de setores "quase mortos" e setores próximos a setores mortos. Veja este link para mais detalhes,
sudo apt-get install gddresue
Aprenda sobre isso na página de informações, que contém muitas informações boas,
info ddrescue
e siga um dos exemplos.
Por favor, esteja ciente de que o Windows XP não recebe mais atualizações de segurança.