Consegui resolver um problema semelhante (no meu caso, com uma placa de som usb que se desconectaria depois de trabalhar por alguns segundos, somando a porta à qual ela estava conectada) instalando um kernel mais atualizado:
4.9.0-040900rc3-generic
Eu simplesmente baixei o arquivo .deb da minha arquitetura de link e o instalei com o software atualizador.
Após a reinicialização, o dispositivo usb voltou ao seu comportamento normal.