Você pode instalar o Ubuntu na partição Elementary / e selecionar o Elemantary /home como seu Ubuntu /home .
Os dados no /home não serão excluídos.
Você precisa levar em conta que as configurações específicas do usuário também permanecerão. Isso pode causar alguns conflitos com o novo DE.
A melhor maneira é criar um novo usuário no Ubuntu e transferir arquivos para o novo diretório inicial do usuário. Em seguida, exclua o usuário antigo. Isso eliminará todas as configurações.