O Microsoft Powerpoint e o LibreOffice Impress usam diferentes transições e formatos de arquivo padrão. O Powerpoint gosta de alterar as apresentações do LibreOffice em seu próprio formato Powerpoint, o que nem sempre funciona bem.
Para melhor compatibilidade para a apresentação entre seus dois computadores, aconselho usar o LibreOffice Impress no seu computador com Windows para editar apresentações do LibreOffice, em vez de usar o Microsoft Powerpoint.