Não, não será. Será uma instalação fácil.
Embora você possa ainda realizar o que você está procurando: Instale a versão persistente do USB em um disco rígido
Eu usei "instalador USB universal" e criei um sistema Ubuntu portátil na minha unidade flash USB com partição de persistência de 4GB, na qual instalei alguns softwares adicionais. Se eu usar o recurso "Instalar o Ubuntu em um disco rígido" com esta unidade flash, todas as minhas alterações na partição persistente também serão instaladas no disco rígido?
Atualmente, não tenho disco rígido gratuito, por isso não posso experimentar sozinho.
Não, não será. Será uma instalação fácil.
Embora você possa ainda realizar o que você está procurando: Instale a versão persistente do USB em um disco rígido