OK, parece que os programas de linha de comando não são uma opção para você. Então, aqui vem minha recomendação GUI: Audacity .
O Audacity é um excelente editor de áudio multi-plataforma, gratuito e de código aberto. Com ele você pode mesclar, cortar, gravar, aplicar efeitos e fazer centenas de edições em arquivos de áudio. Ele também suporta arquivos de vídeo (o áudio é extraído) e tem ótima integração com a maioria dos ambientes de desktop (incluindo arrastar / soltar). Ele também codifica / exporta seus projetos incrivelmente rápido (mesmo em qualidades superiores).
Está disponível para Linux / Unix, Mac OS X e Microsoft Windows.
Felizmente, o Audacity está nos repositórios oficiais do Ubuntu, então você pode instalá-lo usando o Centro de Software. Pesquise o Audacity e instale-o.
Você também pode fazer isso por meio da linha de comando, executando
sudo apt-get install audacity
Este é o site oficial deles, onde você pode obter mais informações: