~
é um atalho para o seu diretório pessoal. Então, você digita cd ~
para acessar seu diretório pessoal ou cd ~/Desktop
para acessar sua área de trabalho.
No entanto, se você usou sudo su
para se tornar root, isso não funcionará - ele levará você ao diretório inicial do root.
cd /home/<your username>/Desktop
sempre levará você à sua pasta da área de trabalho se você tiver permissões de acesso. Não tenho certeza se há uma maneira mais rápida enquanto logado como root.