Sim, você pode. Mas, durante o login, vá para o canto superior direito (na verdade não exatamente na esquina), e você verá um pequeno ícone para alterar o ambiente de área de trabalho no qual você precisa inicializar. Clique nele e escolha a área de trabalho Unity. (Veja o 4º ícone no canto superior direito da imagem) 
Lembre-se que a instalação de outro desktop não é muito eficiente e causará problemas como ícones fora de lugar, problemas de tema etc., embora a maioria das coisas funcione bem. Então, se você está testando o Unity, está tudo bem. Mas, se você quiser continuar com o Unity, sugiro que você instale o Ubuntu com a área de trabalho Unity novamente. Mesmo se você não fizer isso, está tudo bem. As coisas vão correr bem.