O Ubuntu e muitas outras distribuições fazem alterações no que o GNOME faz. O Ubuntu GNOME está tentando enviar uma experiência mais GNOME de baunilha. No entanto, até mesmo esse projeto tem que trabalhar em torno de pacotes mais antigos no repositório do Ubuntu.
Então, para responder a sua pergunta, o Ubuntu irá modificar o GNOME, no entanto, eles acham que é melhor fornecer o melhor ajuste para o ecossistema do Ubuntu. O projeto ainda usa muitos dos programas e recursos do GNOME no lançamento padrão, mas nem tudo. Portanto, há partes do GNOME que não vêm com o padrão do Ubuntu, que podem ser adicionadas após a instalação.
Se você está procurando uma experiência melhor no GNOME, então você deve verificar o Fedora. Esse projeto é basicamente o padrão ouro para a área de trabalho do GNOME.