O que é o Bogofilter?
Como você entendeu corretamente, o bogofilter é um filtro de e-mail que classifica e-mails como spam ou ham (não-spam) por uma estatística análise do cabeçalho e conteúdo da mensagem (corpo).
Posso remover os bogofilters e não quebrar meu sistema?
Não vejo problema em desinstalar o Bogofilter. Se você desinstalar o bogofilter, você não vai bagunçar o Ubuntu. Às vezes, o bogofilter pode vir (ou pode ser) integrado com clientes de e-mail, como Claws Mail, KMail, Evolution, etc., e outros agentes de entrega de e-mail. Então, se você desinstalá-lo, poderá perder essa funcionalidade. Dito isso, pelo menos o Evolution não vem integrado ao bogofilter (em vez disso, acho que o Evolution usa o SpamAssasin)