O problema é que você tem muitos ppas.
O Apt só pode manipular 40 chaves em /etc/apt/trusted.gpg.d
.
Exclua algumas chaves gpg e ppas.
Veja aqui mais algumas informações.
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Como você não tem o diretório /etc/apt/trusted.gpg.d, basta executar o seguinte comando para corrigir o problema:
sudo mkdir /etc/apt/trusted.gpg.d