O executável é
/opt/SceneBuilder/SceneBuilder
Por quê? É por isso.
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dpkg -L scenebuilder | grep bin
não fornece saída, ok, vamos continuar com o passo 2
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dpkg -L scenebuilder | grep desktop
dá
/opt/SceneBuilder/SceneBuilder.desktop
e
grep 'Exec=' /opt/SceneBuilder/SceneBuilder.desktop
dá
Exec=/opt/SceneBuilder/SceneBuilder
e esse é o seu executável.
Você também pode usar
find /opt/SceneBuilder -type f -executable
mas na instalação há tantos atributos configurados incorretamente, isso não faz sentido. A saída do comando tem 99 entradas.