compiz armazena um arquivo chamado 'firstrun' sob o caminho ~/.config/compiz-1/compizconfig
. Então, tudo que você tem é excluir esse arquivo e, em seguida, executar o CCSM novamente para mostrar a caixa de diálogo de aviso.
sudo rm -f ~/.config/compiz-1/compizconfig/firstrun
Dica: Em geral, você não precisa usar sudo dentro de sua casa, mas aqui você tem que usar o sudo, mesmo em seus diretórios home, pois esse arquivo e outros Default.ini são de propriedade de root.