Uma possibilidade seria executar o iTunes no Ubuntu PC através do Wine. Pelo que eu ouvi, a parte de sincronização não funciona, mas os recursos de airplay fazem.
A segunda opção é usar o Ubuntu One, se você quiser apenas reproduzir áudio de acordo com: Blog do Ubuntu One
A terceira solução seria instalar um servidor de mídia no PC Ubuntu como este guia dita.
Aviso: Não tenho uma Apple TV ou mesmo um Mac, por isso não testei nenhuma das soluções propostas. =)
Teste feliz!