Você está correto, o Nautilus armazenará as miniaturas em cache para que não precise recriá-las toda vez que elas forem exibidas. No entanto, tenha em mente que:
- Levará muito tempo para criar miniaturas para 46.000 imagens, especialmente se houver muitas imagens grandes
- Se não terminar de criar todas as miniaturas, ela será reiniciada na próxima vez que você visualizar a pasta
- O Nautilus será um pouco lento ao carregar um diretório com 46.000 arquivos de qualquer tipo, sem falar nas imagens que precisam de miniaturas
Por causa disso, sugiro usar um programa diferente para essa tarefa. Eu descobri que o Gthumb faz um trabalho melhor do que o Nautilus ao trabalhar com um monte de fotos. A exibição de catálogo permite ver todas as miniaturas e você pode abrir uma foto para ver mais de perto. Ainda é utilizável ao gerar miniaturas em segundo plano. Listando que muitos arquivos para começar ainda vai demorar um pouco embora.
Outra opção é tentar alguns navegadores de arquivos alternativos .
Por fim, você pode executar um script para dividir os arquivos em subpastas para torná-lo mais gerenciável.