Eu dificilmente acho que realmente haja problemas com o BIOS. Eu sei que às vezes o Windows pode ficar um pouco exigente se de repente ele vê que sua partição raiz é menor do que era antes. Normalmente, apenas faz uma simples verificação de disco e é isso. Mas, em alguns casos, você pode precisar reativar o Windows. Isso geralmente acontece quando você faz uma alteração de hardware, mas eu vi alguns casos em que uma nova configuração de inicialização dupla produz a mesma coisa.