Basta instalar o Windows no SSD e instalar o Ubuntu ao lado do Windows. Isso lhe dará uma configuração de inicialização dupla acionada por um menu grub. Ambos os sistemas operacionais verão sua unidade de 3 TB que estará disponível para armazenamento de dados em qualquer sistema. Com um SSD de 120 GB, não deve haver problemas em ter espaço suficiente disponível para a instalação do programa. Eu tenho o Windows 7 e o Mint 13 rodando alegremente juntos em um SSD de 60 GB, com um disco de 1 TB como armazenamento suplementar.