Não há limite de tempo em tarefas agendadas, se é isso que você está pedindo. O problema deve estar em outro lugar.
Tente adicionar set -vx
em seus scripts e redirecione a saída para um arquivo:
./Desktop/Backup.sh > /tmp/Backup.log 2>&1
Muitas vezes, o problema com tarefas agendadas é que o script de login do usuário não é executado. Tente adicionar source ~/.bash_login
(se bash) no começo do script.
Além disso, use o caminho absoluto no cron (não é um erro, é mais uma boa prática)