Basta selecionar a partição ext4 onde o ubuntu está instalado.
Eu tenho um RAID 0 (2x drives de 300GB) com o Windows 7 e o Ubuntu 13.10 (partição de 58GB ext4, com partição de swap de 5GB) neles. Acabei de conseguir que meu boot duplo funcione.
No entanto, quando fui atualizar alguns softwares no Ubuntu Software Center, a janela "Configurando o grub-pc" apareceu e mostra o seguinte:
Qual desses eu devo marcar para atualizar / instalar o Grub?
EDIT: Se eu fizer:
df | grep /$
diz:
/dev/mapper/isw_dcgidgaidc_Linux2
Basta selecionar a partição ext4 onde o ubuntu está instalado.