Não, não há perda de nenhuma funcionalidade, você pode facilmente atualizar e executar o gnome 3 como um gerenciador de desktop.
Agora eu quero mudar de volta para o Ubuntu, mas eu ainda não gosto da unidade desktop, então eu queria saber se há algum problema em instalar e usar o Gnome 3 ou Mate como um gerenciador de desktop com o Ubuntu.
Perco alguma funcionalidade? Existe algum software que depende do Unity para funcionar?
Não, não há perda de nenhuma funcionalidade, você pode facilmente atualizar e executar o gnome 3 como um gerenciador de desktop.