Os pacotes click são projetados para serem aplicativos autônomos que atualmente são suportados apenas na versão para telefone / tablet do Ubuntu. Eles não podem especificar dependências em outros pacotes (como o pascal livre, que não está incluído no Ubuntu). Uma vez que a convergência total é aumentada no Ubuntu, deve ser possível empacotar mais aplicativos como o seu, como pacotes de cliques.
Por enquanto, sua melhor opção provavelmente será criar um PPA para seu aplicativo no Launchpad, e criar pacotes Debian ( deb ) para as dependências e o próprio aplicativo.