Eu odeio essa resposta porque é como quebrar cegamente com uma marreta quando eu deveria encontrar a causa real, mas é o que eu fiz quando várias atualizações estragaram o ambiente de desktop:
- pressione Ctrl-Alt-F1 para obter um terminal não gráfico
- faça login como eu
- tar cvfz config-arquivos-2013-maio-30.tar.gz .config .gconf
- rm -rf .config .gconf
- sair
- pressione Ctrl-Alt-F7 para voltar ao login gráfico
- faça o login como eu e os diretórios .config e .gconf são feitos novamente pelo gerenciador de exibição.
Obviamente, o passo (3) está presente caso isso torne as coisas piores.
Eu realmente odeio essa resposta, mas me leva de volta ao trabalho. Espero que alguém publique um melhor.