Como você criou as partições? Quando tentei criar partições no meu SSD Samsung 840 Pro usando o Windows, também tive problemas, então inicializei o LiveCD e usei o GParted, o que funcionou muito bem.
No que diz respeito à instalação do Ubuntu no SSD, eu tenho uma instalação limpa do Ubuntu 12.10 no disco SSD que eu mencionei anteriormente, mas há uma pegadinha: eu não tenho nenhuma partição swap. Por que nenhuma partição swap (você pode perguntar), esse homem é insano? Bem, eu percebi que com 8GB de RAM na minha máquina, eu não preciso de swap. Eu nunca cheguei ao limite de 8GB, e eu não acho que vou no futuro próximo.Se o seu computador também tem muita memória RAM, você pode querer considerar esta solução. Se não, você poderia tentar criar a partição swap no seu HDD em vez de criá-la no SSD.
Gostaria de poder ser mais útil, é tudo o que tenho: s
EDIT: Parece que alguns dispositivos Samsung estão conectados ! Eu não sei, mas este pode ser o seu caso.