Sim, você pode. A atualização não seria um problema, você usaria o apt-get. Quase certamente seria melhor atualizar ao executar o convidado no KVM.
Para usar é para o LXC, você montaria o disco e especificaria o local da montagem na configuração do LXC.
Para fazer isso, use libguestfs
apt-get install libguestfs-tools
Você poderia montá-lo com a quantidade de convidados
Só não se esqueça de montar um convidado KVM em execução (bem, você pode montá-lo RO).
guestmount -a your_kvm.img /mount_point
Veja também