Esta situação é sintomática de um driver ausente. A instalação do Ubuntu-via-VirtualBox tem a vantagem de passar pelos drivers do Windows antes de tocar no hardware.
Sua nova placa-mãe usa um chip LAN Atheros GbE, que é relativamente novo e pode demorar um pouco para receber suporte completo do kernel. O UbuntuForums tem uma boa postagem sobre duas opções de instalação de drivers.
A postagem direcionará você para a mais nova das opções de driver, com detalhes no link .
A partir desse post, você pode ver como obter manualmente o driver necessário:
sudo apt-get install linux-headers-generic build-essential
wget http://www.orbit-lab.org/kernel/compat-wireless-3-stable/v3.5/compat-wireless-3.5.1-1-snpc.tar.bz2
tar -xf compat-wireless-3.5.1-1-snpc.tar.bz2
cd compat-wireless-3.5.1-1-snpc
./scripts/driver-select alx
make
sudo make install
sudo modprobe alx
Se você tiver um dongle USB WiFi, poderá usá-lo para se conectar à Internet para a etapa wget . Caso contrário, faça o download desse arquivo de outro computador e transfira-o em uma unidade flash. O último link acima tem mais informações para lidar com a falta de conexão com a Internet.