Embora não consegui encontrar os atalhos, podemos usar a pasta .local/share/applications
.
Você pode criar um arquivo dessa maneira:
gedit ~/.local/share/applications/myskype.desktop
Em seguida, cole algo assim:
[Desktop Entry] Version=1.0 Name=My Skype Exec=env LD_PRELOAD="/usr/lib32/libv4l/v4l1compat.so" skype Terminal=false X-MultipleArgs=false Type=Application Icon=skype Categories=GNOME;GTK;Network; StartupWMClass=Skype StartupNotify=true X-Ayatana-Desktop-Shortcuts=NewWindow; [NewWindow Shortcut Group] Name=Open a New Window Exec=env LD_PRELOAD="/usr/lib32/libv4l/v4l1compat.so" skype TargetEnvironment=Unity
Salve e saia.