De falar com um dos desenvolvedores do hid-multitouch, os seguintes comandos irão contornar este problema no Ubuntu 12.10:
sudo su
echo 16 > /sys/module/hid_multitouch/drivers/hid\:hid-multitouch/0003\:1403\:5001.*/quirks
Uma atualização futura do kernel consertará as coisas para que isso não seja mais necessário.