Não deve ser perdido, desde que você não formate a sua unidade. Ele provavelmente também honrará as entradas no Gerenciador de Inicialização do Windows (armazenamento BCD), mas isso é algo que você precisa verificar com a documentação de atualização do Windows 8 - se não, você pode sempre adicioná-lo manualmente.
No entanto, se você se preocupa com a sua instalação do Ubuntu, então é aconselhável fazer o backup. Você deve fazer isso de qualquer maneira, porque as instalações do Wubi podem ser corrompidas mais facilmente do que uma instalação normal. O que você deve fazer é fazer backup de todo o diretório \ubuntu\disks . Contém o arquivo principal, root.disk , o disco virtual e swap.disk e, em seguida, alguns subdiretórios vazios (sem importância). Em algumas instalações, pode haver outros discos virtuais, por ex. home.disk , usr.disk , mas normalmente há apenas os dois.
Se você fizer backup deles, é fácil restaurar a instalação mesmo se a atualização falhar.
O Windows 8 funciona bem com o Wubi - desde que você não habilite a suspensão híbrida (não ativada por padrão). O início rápido (que está ativado) é bom para o Wubi.
Fazendo backup de uma instalação do Wubi
Você pode simplesmente copiar o diretório \ubuntu\disk ou os arquivos .disk separados para uma unidade externa. O Wubi instala o Ubuntu em discos virtuais que são montados como dispositivos de loop , mas são apenas arquivos físicos no host NTFS ou FAT32 (Windows) "drives". Então, fazer backup deles é tão simples quanto copiar os arquivos para uma unidade externa.
Esta não é a maneira mais eficiente de fazer o backup de uma instalação do Wubi, já que você também está copiando o espaço livre no disco virtual, além de todos os arquivos, pacotes e cache gerais do SO que você normalmente não faria backup. Mas a simplicidade compensa isso.
Se você precisar restaurar a partir do backup, basta substituir os arquivos .disk do backup. Isso também é conveniente ao tentar fazer upgrades ou se você quiser apenas brincar com algumas coisas e teme que não seja possível desfazê-lo mais tarde.
Você pode até mesmo reinstalar a mesma versão do Wubi e depois substituir os novos arquivos .disk pelos backups, mas eles precisam estar na mesma partição, ou então você precisa fazer um pouco de inicialização manual com o primeiro Tempo. Veja isto para detalhes: moveu a pasta ubuntu de C: para D: dirija como corrigir entradas de UUID
Backups de dados
Também é uma boa ideia manter backups de dados separados, que podem ser feitos para uma instalação normal, concentrando-se apenas em dados pessoais e configurações. Eu prefiro usar o Ubuntu One para manter todos os dados totalmente sincronizados e com dados que não precisam estar nos discos virtuais, por exemplo, jpegs e mp3s etc., eu os armazeno na partição / host ou em outra partição montada. Esta é a maneira mais segura de usar o Wubi, já que parece haver muitos casos de corrupção do sistema de arquivos que podem levar a uma perda total da instalação.