Sua linha de comando está mostrando que, mesmo que você esteja invocando nvcc
do diretório CUDA 5.0, você acaba iniciando as ferramentas de compilação do CUDA 4.2. Esta versão não suporta a compilação para capacidade de computação 3.5.
Então, o seu principal problema é que você não está invocando o compilador correto. Além disso, você tem um dispositivo de capacidade de computação 3.5? Isso seria um dispositivo baseado no novo chip GK110. Eu acho que o único cartão disponível agora é o Tesla K20.
Se você não tiver uma placa K20, terá que compilar para uma capacidade de computação menor. Isto é, altere compute_35
para, por exemplo, compute_20
, para um cartão baseado em Fermi. Isso é independente de qual compilador você usar.