Você precisará modificar /etc/X11/xorg.conf para torná-lo permanente.
Já deve haver configurações para ratos lá (veja abaixo), você só precisa alterar as opções de aceleração.
Section "InputClass"
Identifier "My Mouse"
MatchIsPointer "yes"
Option "AccelerationNumerator" "1"
Option "AccelerationDenominator" "1"
Option "AccelerationThreshold" "0"
EndSection