O problema é que, usando a raiz em vez do alias, ela aparecerá no caminho errado. Também no http o usuário era www-alguma coisa e não tinha permissões, obrigado ubuntu, então agora eu tive que mudar para o meu nome e deu certo:
- Alias em vez de root para o caminho certo
- Defina o usuário certo que tenha permissões para a pasta desejada