Possivelmente, essa é uma forma de um bug conhecido . Se de fato, então não irá se manifestar no Ubuntu 2D. Tente sair e escolher 2D como sua sessão; você ainda sente o mesmo problema?
Se não, então seu problema está relacionado ao compiz. Compiz em 12.04 tem vários bugs. Eu tive que instalar uma versão mais antiga do Compiz de um PPA; as instruções são aqui . No entanto, como uma palavra de aviso, algumas pessoas relatam que eles ainda têm o seu problema ("menus brancos"), mesmo quando se utiliza esta versão compiz; veja o comentário # 144 aqui .
Para mudar para Unity 2D, saia e, quando chegar à tela de login, clique no logo do Ubuntu na parte superior do painel, logo à direita do seu nome de login. Selecione Unity 2D no menu suspenso, digite sua senha e continue com o login. Se você errar a senha, terá que selecionar novamente o Unity 2D no menu suspenso, pois ele retornará ao padrão anterior.