Você precisa configurar as partições para que a configuração inicial seja / dev / sdb1 (por exemplo) durante a configuração. Existe uma opção para "Outra coisa" durante a instalação na seção do disco rígido. Contanto que você crie os usuários na mesma ordem, deve fazer as permissões corretamente (sem promessas, é claro).
Eu não estou 100% apenas copiando e colando os arquivos e permissões em dizer nautilus, mas você sempre pode executar sudo chown <user>:<user> -R /home/<user>
depois de copiá-lo para definir a pasta para o proprietário correto. Isso deve definir tudo corretamente.