Uma boa solução seria o bchunk , também chamado de BinChunker, disponível para Linux e Unix.
Você pode instalá-lo via Terminal: sudo apt-get install bchunk
Uso: bchunk [-v] [-r] [-p (PSX)] [-w (wav)] [-s (swabaudio)] (man page do bchunk)
Exemplo:
Por favor, consulte o link acima, para mais informações e se você encontrar algum problema, edite o seu post e eu entrarei em contato com você!