De acordo com isto resposta no ServerFault que você precisa fazer:
sudo mkdir -p /var/cache/apt/archives/partial
sudo touch /var/cache/apt/archives/lock
sudo chmod 640 /var/cache/apt/archives/lock
Eu inicialmente tive um problema com o apt-get update. Parou em 99%, "esperando por cabeçalhos". Esse problema ocorreu ao tentar instalar o GeoGebra seguindo as instruções na página .
Tentando resolver este problema, apaguei a pasta apt do / var / cache. Agora o apt-get não funciona de todo. Não tenho ideia de como resolver esse problema. O Ubuntu funciona bem, mas não consigo instalar novos softwares. Por favor ajude!
De acordo com isto resposta no ServerFault que você precisa fazer:
sudo mkdir -p /var/cache/apt/archives/partial
sudo touch /var/cache/apt/archives/lock
sudo chmod 640 /var/cache/apt/archives/lock