Você deve instalar os drivers mais recentes para o seu cartão, eles dão um suporte muito melhor do que os incluídos nos repositórios do Ubuntu.
Se você precisar de alguma ajuda para instalar os drivers da ATI em seu sistema, dê uma olhada nesta questão A minha placa gráfica ATI é suportada no Ubuntu? Ela ajudará você a baixar e instalar os drivers mais recentes em seu sistema.
Os drivers incluídos (fglrx 11.08 e fglrx 11.09) nos repositórios do Ubuntu não são realmente os melhores para apreciar completamente o Unity, só depois da atualização para o fglrx 11.11 eu tive uma boa experiência com ele, sem mais lentidão e janelas penduradas filmes. Tudo funcionou muito, muito melhor.
O guia que eu incluí irá instalar o fglrx 11.12, eles são os atuais drivers mais recentes da ATI.