Não há perigo para a sua partição do Windows, mas o BURG será substituído pelo GRUB se você atualizar para o Ubuntu 12.04. Também não funcionou muito bem com upgrades normais para mim (estou me referindo a algo tão simples quanto aplicar atualizações no sistema).
Para ser honesto, a maior parte do que a BURG pode fazer, o GRUB pode fazer agora se configurado corretamente, então eu não aconselharia ir com a BURG.