É um problema conhecido com o FGLRX e o Ubuntu. Eu pensei que isso só aconteceu com o Unity-2D, mas de acordo com o que você está dizendo, isso também acontece com o desktop clássico. Todas as janelas do OpenGL sofrem com esse problema. Dê uma olhada aqui: link Para desabilitar o webgl no Firefox você pode digitar about: config na barra de endereços e procurar por webgl.