Eu não sei se isso será de alguma ajuda, e estou longe de ser um especialista em Ubuntu, mas eu estava tendo um problema semelhante. Depois de instalar o "Driver adicional" recomendado para a placa Nvidia no meu Pavilion TX2000, experimentei uma lentidão terrível quando naveguei em um navegador, alternando os desktops e basicamente qualquer coisa que usasse o gerenciador de janelas. Eu tentei usar a instalação fornecida pela NVidia, mas o Gnome não carregaria depois que eu fiz isso, então voltei para o driver recomendado. A tentativa de instalação da NVidia adicionou uma opção "NVidia X Server Settings" ao menu System- > Administration. Carreguei isso e observei que, na seção "Configuração do X Server Display", "Resolution" estava definido como "Auto". Mudei isso para 1280x800 (a propósito, o mesmo valor escolhido pela configuração "Auto") e, em seguida, defina a taxa de atualização de "Auto" para "60 Hz". Depois de aplicar essa configuração, o problema parece estar resolvido. Eu não sei se isso será aplicável ao sistema de qualquer outra pessoa, mas eu achei que valeria a pena colocar lá fora.