O código dado por Knud Larsen foi útil para criar um DVD inicializável:
mkisofs -o [path-to]/new.iso -b isolinux/isolinux.bin -c isolinux/boot.cat -no-emul-boot -boot-load-size 4 -boot-info-table -J -R -V disks ./
Eu poderia inicializar em um menu, mas não consegui fazer com que os aspectos do multi OS funcionassem, não importando o quanto eu interagisse com o isolinux / syslinux. No final, o MultiCD foi a melhor solução, funciona bem e é fácil de usar.