Acho que isso é provável porque o pacote unity-scope-home não está instalado.
Tente usar o Centro de software para encontrar e instalar esse pacote, faça logout e login novamente para reiniciar o Unity e veja se isso resolve o problema.
Eu fiz o upgrade de 13.04 para 13.10 e agora todos os ícones da lente do aplicativo desapareceram.
Isso é o que eu tentei até agora:
apt-get install --reinstall unity-lens-applications
unity --replace
e unity --reset-icons
~/.config
para ~/.config2
~/.cache/software-center
e ~/.cache/unity
A maioria dessas coisas foi sugerida nesta pergunta: A lente Applications Unity está vazia - mas tudo sem sucesso.
Acho que isso é provável porque o pacote unity-scope-home não está instalado.
Tente usar o Centro de software para encontrar e instalar esse pacote, faça logout e login novamente para reiniciar o Unity e veja se isso resolve o problema.
Acho que posso ter tido um problema semelhante, não tenho certeza se foi devido ao upgrade para 13.10 ou devido a erro do usuário. Acabei fixando da seguinte forma:
Bit drástico, mas funcionou.