Pessoalmente, eu limparia o disco primeiro e depois formatá-lo.
Para limpar um disco eu usaria o comando
sudo dd if=/dev/zero of=/dev/sdX* bs=1M status=progress
* substitua sdX pelo local da unidade de destino.
Para obter uma lista de unidades e suas partições, execute lsblk .
Certifique-se de listar apenas o código da unidade, por exemplo, mmblk0 / sda e não uma partição nesse dispositivo, por exemplo, mmblk0p1 / sda1
Isso sobrescreverá todos os bits do disco com 0s, mas isso pode levar algum tempo. Mas no final, não haverá nada sobre isso.
Depois que a unidade tiver sido limpa, você poderá formatá-la como desejar.
Eu geralmente usaria o comando mkfs como sugerido na resposta de Lorenzo. No entanto, se eu usasse uma ferramenta gráfica, eu recomendaria o gparted
O 'se' é a parte a ser copiada para o disco e o 'de' é o local para o qual ela deve ser gravada, a parte do status significa que ela mostrará o progresso da operação como vai junto.