Ok, descobri a solução para isso, espero que ajude algumas pessoas.
O usuário é preso a / var / www / sites. Eu então criei outra pasta / var / www / sites / site1. Eu faço root: webmaster / var / www / sites / site1 assim como chmod 775 / var / www / sites / site1. Isso permitiu que o diretório inicial tivesse as permissões corretas para efetuar login e, em seguida, pudesse gravar na próxima pasta.
Se o usuário precisar de acesso de escrita a / var / www / sites, você deve prender o usuário em / var / www, que tem root: propriedade root e permissões de 755. Você então precisa dar / var / www / sites propriedade do root: (seu grupo) e permissões de 775.