Eu tive um problema semelhante e os procedimentos a seguir funcionaram para mim.
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Abra o arquivo de configuração do Apache usando um editor de texto de sua escolha, o meu é
gedit:sudo -H gedit /etc/apache2/apache2.conf -
Adicione a seguinte linha em qualquer lugar:
Include /etc/phpmyadmin/apache.conf -
Reinicie o Apache:
sudo service apache2 restart