Seu problema de OPENGL e libstdc ++
Primeiro, instale alguns pacotes
$ sudo apt-get install lib64stdc++6:i386
$ sudo apt-get install mesa-utils
Em seguida, atualize alguns links:
cd <your_matlab_location>/sys/os/glnxa64/
$ sudo mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6.bak
$ sudo ln -s /usr/lib64/libstdc++.so.6 libstdc++.so.6
execute o matlab check se a mesa é atualizada no terminal matlab
>> opengl info
Version: '3.0 Mesa 17.0.3'
Vendor: 'Intel Open Source Technology Center' ..............
HardwareSupportLevel: 'full'
..........
Agora o opengl deve estar funcionando ....