sudo rm -rf ~/.config
parece uma solução temporária (hardcore) para o problema. Exclui todas as configurações da área de trabalho.
Isso funciona, mas o problema reapareceu após uma tentativa fracassada de alterar a resolução novamente, como mencionado acima. Contanto que eu não escolha uma resolução de tela que não possa ser definida, o problema não reaparece.