Parece-me que você pode ter instalado o grub na segunda unidade quando estava instalando o seu "backup". tente arrancar a partir do seu segundo disco e veja se o Grub aparece como deveria.
Também pode ter ocorrido um erro ao instalar o grub. Você pode baixar um utilitário chamado Rescatux que permitirá a reinstalação do Grub. Se minha primeira recomendação não funcionar, tente instalar o grub com o utilitário Rescatux em seu / dev / sda e tente inicializar em sua instalação.
O utilitário Rescatux pode ser encontrado aqui: link