Eu instalei o mcrypt seguindo os comandos do Ubuntu 14.04
$ sudo apt-get install php5-mcrypt
$ sudo php5enmod mcrypt
$ sudo service apache2 restart
Agora, quando eu olho para o phpinfo, ele mostra que o mcrypt está habilitado, mas quando olho para o terminal com php -m [PHP Modules] ele não mostra o mcrypt.
Como resolver o problema acima?