Parece que você está usando o driver noveau. Gostaria de sugerir mover o xorg.conf para fora do caminho, reinicializar e, em seguida, configurar a exibição desejada usando o painel Configurações de exibição em Configurações do sistema.
Uma vez que você tenha sua configuração funcionando como desejado, você pode copiar o arquivo ~/.config/monitors.xml
para /etc/gnome-settings-daemon/xrandr/monitors.xml
para que a configuração seja aplicada na inicialização do lightdm também.