Você pode remover o touchpad e reinstalá-lo. Às vezes isso corrige problemas como esse.
Veja se está listado no xinput com
xinput list
Se for, verifique se está ativado ou não. Se não estiver na lista, então desinstalar e reinstalar os drivers com o apt-get parece ser a melhor opção, já que não conheço suas especificações de hardware.
Qual laptop você tem e que tipo de touchpad?